Association of vitamin D receptor gene polymorphisms with type 2 diabetes mellitus in Taif population: a case-control study

Abstract Several reasons may underlie the dramatic increase in type2 diabetes mellitus. One of these reasons is the genetic basis and variations. Vitamin D receptor polymorphisms are associated with different diseases such as rheumatoid arthritis and diabetes. The aim of this study is to investigate the possible association of two identified mutations ApaI (rs7975232) and TaqI (rs731236). Eighty-nine healthy individuals and Fifty-six Type 2 Diabetic (T2D) patients were investigated using RFLP technique for genotyping and haplotyping as well. The distribution of Apal genotypes was not statistically significant among the control (P=0.65) as well as for diabetic patients (P=0.58). For Taql allele frequencies of T allele was 0.61 where of G allele was 0.39. The frequency distribution of Taql genotypes was not statistically significant among the control (P=0.26) as well as diabetic patients (P=0.17). Relative risk of the allele T of Apa1 gene is 1.28 and the odds ratio of the same allele is 1.53, while both estimates were 1.0 of the allele G. Similarly, with the Taq1 gene the relative risk and the odds ratio values for the allele T are 1.09 and 1.27 respectively and both estimates of the allele C were 0.86 for the relative risk and 0.79 for the odds ratio. The pairwise linkage disequilibrium between the two SNPs Taq1/apa1 was statistically significant in control group (D = 0.218, D' = 0.925 and P value 0.001) and similar data in diabetic groups (D = 0.2, D' = 0.875 and P value 0.001). These data suggest that the T allele of both genes Apa1 and Taq1 is associated with the increased risk of type 2 diabetes. We think that we need a larger number of volunteers to reach a more accurate conclusion.

Resumo Várias razões podem estar subjacentes ao aumento dramático da diabetes mellitus tipo 2. Um desses motivos é a base genética e variações. Os polimorfismos do receptor da vitamina D estão associados a diferentes doenças, como artrite reumatoide e diabetes. O objetivo deste estudo é investigar a possível associação de duas mutações identificadas ApaI (rs7975232) e TaqI (rs731236). Oitenta e nove indivíduos saudáveis e 56 pacientes com diabetes tipo 2 (T2D) foram investigados usando a técnica RFLP para genotipagem e haplotipagem também. A distribuição dos genótipos Apal não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,65), bem como para os pacientes diabéticos (P = 0,58). Para as frequências do alelo Taql, o alelo T foi de 0,61, onde o alelo G foi de 0,39. A distribuição de frequência dos genótipos Taql não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,26), bem como os pacientes diabéticos (P = 0,17). O risco relativo do alelo T do gene Apa1 é 1,28 e a razão de chances do mesmo alelo é 1,53, enquanto ambas as estimativas foram 1,0 do alelo G. Da mesma forma, com o gene Taq1, os valores de risco relativo e razão de chances para o alelo T são 1,09 e 1,27, respectivamente, e ambas as estimativas do alelo C foram de 0,86 para o risco relativo e 0,79 para o odds ratio. O desequilíbrio de ligação par a par entre os dois SNPs Taq1 / apa1 foi estatisticamente significativo no grupo de controle (D = 0,218, D' = 0,925 e valor P 0,001) e dados semelhantes em grupos diabéticos (D = 0,2, D' = 0,875 e valor P 0,001). Esses dados sugerem que o alelo T de ambos os genes Apa1 e Taq1 está associado ao aumento do risco de diabetes tipo 2. Achamos que precisamos de um número maior de voluntários para chegar a uma conclusão mais precisa.

Association of vitamin D receptor gene polymorphisms with type 2 diabetes mellitus in Taif population: a case-control study / Associação de polimorfismos do gene do receptor de vitamina D com diabetes mellitus tipo 2 na população Taif: um estudo de caso-controle

Abstract Several reasons may underlie the dramatic increase in type2 diabetes mellitus. One of these reasons is the genetic basis and variations. Vitamin D receptor polymorphisms are associated with different diseases such as rheumatoid arthritis and diabetes. The aim of this study is to investigate the possible association of two identified mutations ApaI (rs7975232) and TaqI (rs731236). Eighty-nine healthy individuals and Fifty-six Type 2 Diabetic (T2D) patients were investigated using RFLP technique for genotyping and haplotyping as well. The distribution of Apal genotypes was not statistically significant among the control (P=0.65) as well as for diabetic patients (P=0.58). For Taql allele frequencies of T allele was 0.61 where of G allele was 0.39. The frequency distribution of Taql genotypes was not statistically significant among the control (P=0.26) as well as diabetic patients (P=0.17). Relative risk of the allele T of Apa1 gene is 1.28 and the odds ratio of the same allele is 1.53, while both estimates were < 1.0 of the allele G. Similarly, with the Taq1 gene the relative risk and the odds ratio values for the allele T are 1.09 and 1.27 respectively and both estimates of the allele C were 0.86 for the relative risk and 0.79 for the odds ratio. The pairwise linkage disequilibrium between the two SNPs Taq1/apa1 was statistically significant in control group (D = 0.218, D' = 0.925 and P value < 0.001) and similar data in diabetic groups (D = 0.2, D' = 0.875 and P value < 0.001). These data suggest that the T allele of both genes Apa1 and Taq1 is associated with the increased risk of type 2 diabetes. We think that we need a larger number of volunteers to reach a more accurate conclusion.

Resumo Várias razões podem estar subjacentes ao aumento dramático da diabetes mellitus tipo 2. Um desses motivos é a base genética e variações. Os polimorfismos do receptor da vitamina D estão associados a diferentes doenças, como artrite reumatoide e diabetes. O objetivo deste estudo é investigar a possível associação de duas mutações identificadas ApaI (rs7975232) e TaqI (rs731236). Oitenta e nove indivíduos saudáveis ​​e 56 pacientes com diabetes tipo 2 (T2D) foram investigados usando a técnica RFLP para genotipagem e haplotipagem também. A distribuição dos genótipos Apal não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,65), bem como para os pacientes diabéticos (P = 0,58). Para as frequências do alelo Taql, o alelo T foi de 0,61, onde o alelo G foi de 0,39. A distribuição de frequência dos genótipos Taql não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,26), bem como os pacientes diabéticos (P = 0,17). O risco relativo do alelo T do gene Apa1 é 1,28 e a razão de chances do mesmo alelo é 1,53, enquanto ambas as estimativas foram < 1,0 do alelo G. Da mesma forma, com o gene Taq1, os valores de risco relativo e razão de chances para o alelo T são 1,09 e 1,27, respectivamente, e ambas as estimativas do alelo C foram de 0,86 para o risco relativo e 0,79 para o odds ratio. O desequilíbrio de ligação par a par entre os dois SNPs Taq1 / apa1 foi estatisticamente significativo no grupo de controle (D = 0,218, D' = 0,925 e valor P < 0,001) e dados semelhantes em grupos diabéticos (D = 0,2, D' = 0,875 e valor P < 0,001). Esses dados sugerem que o alelo T de ambos os genes Apa1 e Taq1 está associado ao aumento do risco de diabetes tipo 2. Achamos que precisamos de um número maior de voluntários para chegar a uma conclusão mais precisa.

Metodología para la evaluación automatizada de la expresión del receptor de vitamina D mediante técnica inmunocitoquímica / Methodology of automated Vitamin D receptor immunocytochemical expression análisis

Introducción: la citología permite examinar células de un tejido de manera mínimamente invasiva, sin embargo, la capacidad de realizar técnicas complementarias como la inmunocitoquímica (ICQ) no está exenta de dificultades. Es el objetivo de nuestro trabajo presentar una metodología que permita la utilización de ICQ automatizada asociada a un análisis automatizado mediante técnica de patología digital. Métodos: se incluyeron 5 sujetos sanos y se obtuvieron muestras de superficie ocular utilizando un citocepillo. La muestra fue procesada de manera automatizada mediante citología en fase líquida. Posteriormente se realizó ICQ automatizada para detectar la positividad nuclear del receptor de vitamina D. Para la evaluación, se utilizaron dos métodos: cuantificación directa bajo microscopio de luz y análisis automatizado usando analizador de imágenes en las diapositivas digitales obtenidas con un Scanner. El porcentaje de positividad encontrado con ambos métodos fueron comparados utilizando la prueba de Kappa. Resultados: todas las muestras presentaron una celularidad adecuada. En todos los casos fue posible realizar ICQ automatizada, más aún, todas las muestras presentaron una calidad óptima. Al comparar ambos métodos (manual versus automatizado) se observó un nivel de acuerdo sustancial (Kappa=0,69). Conclusiones: la metodología presentada en este manuscrito permite la evaluación automatizada de marcadores inmunohistoquímicos de la superficie ocular de manera mínimamente invasiva, siendo similar al conteo manual, pero más objetivo y reproducible. Esta técnica podría ser útil para el estudio proteómico en patologías como la enfermedad por ojo seco.

Introduction: Cytology tests use small amounts of tissue samples for diagnosis as a minimally invasive technique; however, the ability to perform complementary methods such as immunocytochemistry (ICC) is not without difficulties. The aim of our work is to present a method that allows the use of automated ICC associated with an automated image analysis using digital pathology. Methods: Five healthy subjects were included, and ocular surface samples were obtained using a cytobrush. The sample was processed as liquid-based cytology. Automated ICC was subsequently performed to detect vitamin D receptor nuclear positivity. Two methods were used for evaluation: manual counting under a light microscope and automated analysis using an image analyzer on digitized slides. The percentage of positivity found in both methods was compared using the Kappa test. Results: All samples presented adequate cellularity. In all cases, it was possible to perform automated ICC; moreover, all samples presented optimal quality. When comparing both methods (manual versus automated), a substantial level of agreement was seen (Kappa=0.69). Conclusions. The method presented in this manuscript allows the minimally invasive automated evaluation of ocular surface ICC markers, being like manual counting but more objective and reproducible. This technique could be useful for proteomic study in pathologies such as dry eye disease.

Evaluation of ApaI and FokI polymorphism of VDR gene and functional characterization in patients with fibromyalgia / Avaliação do polimorfismo ApaI e FokI do gene VDR e caracterização funcional em pacientes com fibromialgia

Abstract Introduction: Fibromyalgia (FM) is a syndrome of unknown origin characterized by several symptoms, and although its pathogenesis has not been completely elucidated, it seems to be related to inflammatory path-ways and neurochemical changes in the brain. Objective: To evaluate the association between BsmI, ApaI and FokI polymorphisms of the vitamin D receptor (VDR) gene, their polymorphisms, and clinical variables in women with and without FM. Methods: This is a case-control study composed of a group of 53 women with FM and another with 40 women without the disease. The McGill Pain Questionnaire, Fibromyalgia Impact Questionnaire, Pain Visual Analogue Scale and the sit-up test were applied. Real-time PCR was performed to analyze the ApaI and FokI polymorphism. Results: There was a statistical association between race, comorbidity and FM, where 78.4% of the individuals were white and had FM (p < 0.002) and 96.1% had some comorbidity (p < 0.001). Seventy-six point five percent (76.5%) of patients with FM underperformed in the sit-up test (p < 0.001). There was also an association between the genotypic and allele frequencies of the VDR and FM gene Apal and FokI polymorphisms (p < 0.001). In the VDR gene ApaI polymorphism, the CC genotype exhibited a higher frequency in women with FM, the C allele for the Apal polymorphism was 3.33 times more likely, and the FokI polymorphism was 10.9 times more likely to develop FM (p < 0,0001). Conclusion: Women with C allele for ApaI polymorphism are 3.33 times more likely to have FM (95%CI = 1.58-7.02; p = 0.0024), and in FokI polymorphism, the prevalence of T allele is 10.9 times greater (95% CI = 4.76-25.38; p < 0.0001). No significant associations were found in relation to BsmI polymorphism and frequency alleles (p = 0.062 and p = 0.078, respectively).

Resumo Introdução: A fibromialgia (FM) é uma síndrome de origem desconhecida caracterizada por diversos sintomas, e embora sua patogênese não tenha sido completamente elucidada, parece estar relacionada às vias inflamatórias e alterações neuroquímicas no cérebro. Objetivo: Avaliar a associação entre os polimorfismos BsmI, ApaI e FokI do gene do receptor da vitamina D (VDR), seus polimorfismos e variáveis clínicas em mulheres com e sem FM. Métodos: Trata-se de um estudo caso-controle composto por um grupo de 53 mulheres com FM e outro com 40 mulheres sem a doença. Foram aplicados o Questionário de Dor de McGill, Questionário de Impacto da Fibromialgia, Escala Visual Analógica da Dor e o teste de sentar. A PCR em tempo real foi realizada para analisar o polimorfismo ApaI e FokI. Resultados: Houve associação estatística entre raça, comorbidade e FM, onde 78,4% dos indivíduos eram brancos e apresentavam FM (p < 0,002) e 96,1% tinham alguma comorbidade (p < 0,001). Setenta e seis vírgula cinco por cento (76,5%) dos pacientes com FM tiveram desempenho inferior no teste de abdominais (p < 0,001). Também houve associação entre as frequências genotípicas e alélicas dos polimorfismos Apal e FokI do gene VDR e FM (p < 0,001). No polimorfismo ApaI do gene VDR, o genótipo CC apresentou maior frequência em mulheres com FM, o alelo C para o polimorfismo Apal foi 3,33 vezes mais provável, e o polimorfismo FokI teve 10,9 vezes mais chance de desenvolver FM (p < 0,0001). Conclusão: Mulheres com alelo C para polimorfismo ApaI têm 3,33 vezes mais chance de ter FM (IC 95% = 1,58-7,02; p = 0,0024), e no polimorfismo FokI, a prevalência do alelo T é 10,9 vezes maior (IC 95% = 4,76-25,38; p < 0,0001). Não foram encontradas associações significativas em relação ao polimorfismo BsmI e alelos de frequência (p = 0,062 e p = 0,078, respectivamente).

Effect of vitamin D3 supplementation on 25 OHD plasma levels in the presence of VDR gene polymorphisms / Efecto de la suplementación con vitamina D3 en los niveles plasmáticos de 25 OHD, en presencia de polimorfismos del gen VDR

The objective of this review was to investigate the effect of vitamin D3 supplementation on serum 25-hydroxyvitamin D concentration in individuals with single-nucleotide polymorphisms in the vitamin D receptor gene. The research was conducted on 241 articles found in the PubMed, Scopus, Science Direct, and Cochrane Library databases between November and December 2018. After article screening, three randomized double-blind placebo-controlled clinical trials were identified as eligible for this review. Participants were Australian, Brazilian, and Chinese individuals, who ingested doses of vitamin D3 ranging from 2000 IU to a megadose of 200,000 IU. The presence of the BB/Bb genotype of the BsmI polymorphism and the FokI G allele caused an increase in the serum concentrations of vitamin D after supplementation. Nonetheless, the few studies on this subject are not unanimous in their results. It is possible that differences among populations, sample sizes, doses, and time of supplementation have an impact on data and outcomes.

El objetivo de esta revisión fue investigar el efecto de la suplementación con vitamina D3 sobre la concentración sérica de 25-hidroxivitamina D en individuos con los polimorfismos de un solo nucleótido en el gen del receptor de la vitamina D. La investigación se realizó en 241 artículos encontrados en las bases de datos PubMed, Scopus, Science Direct y Cochrane Library entre noviembre y diciembre de 2018. Después de la selección del artículo, se identificaron tres ensayos clínicos aleatorios, controlados con placebo, doble ciego, como elegibles para esta revisión. Los participantes fueron australianos, brasileños y chinos, quienes ingirieron dosis de vitamina D3 que iban desde las 2000 UI hasta una megadosis de 200,000 UI. La presencia del genotipo BB / Bb del polimorfismo BsmI y el alelo FokI G causó un aumento en las concentraciones séricas de vitamina D después de la suplementación. No obstante, los pocos estudios sobre este tema no son unánimes en sus resultados. Es posible que las diferencias entre poblaciones, tamaños de muestra, dosis y tiempo de suplementación tengan un impacto en los datos y resultados de la investigación.

Association between polymorphisms of the androgen and vitamin D receptor genes with prostate cancer risk in a Mexican population / Asociación entre polimorfismo de andrógenos y receptores de vitamina D con riesgo de cáncer prostático en una población mexicana

Introduction. Prostate cancer (PCa) is a worldwide health issue, because of its high incidence and mortality. Its etiology is complex and includes certain risk factors such as age, hormonal status, ethnic origin and family history of PCa. Genetic predisposition is proposed as a major risk factor and there are several controversial reports on the association of PCa and gene polymorphism such as the receptors of the androgen receptor (AR) and the vitamin D (VDR). Objective. To evaluate the CAG triplets repetitions in the first exon of the AR and polymorphisms in the restriction site Taql in the VDR in Mexicans with PCa. Material and methods. A total of 68 Mexicans with histopathological diagnosis of PCa and 48 healthy Mexican with normal prostate specific antigen and rectal exam where included. 10ml of peripheral blood were extracted to isolate DNA and the polymorphisms were evaluated with specific primers for the AR and VDR. Results. The allelic and genetic distributions of the AR and VDR polymorphisms were consistent with the Hardy-Weinberg equilibrium, and there were no statistical differences between the PCa patients and controls (p > 0.05). However, there was a statistical difference between the number of CAG repeats in younger patients with PCa compared to controls (p = 0.045) but when the young patient group was compared versus the elder group there was not stadistically difference (p = 0.085), but the results showed a tendency towards less repetitions of CAG in elder patients. Concerning the VDR, when we analyzed the patients with PCa and a bad pathological prognosis they had a less frequent genotype of TT (p = 0.03). Conclusions. Our results suggest an association between the VDR and AR gene polymorphisms, and the hystopathological score and age at diagnosis in Mexican patients with PCa, respectively. However, it is important to confirm these results in a larger scale study.

Introducción. El cáncer de próstata (PCa) es un problema de salud mundial, tanto por su elevada incidencia como mortalidad. Su etiología es compleja e incluye factores de riesgo reconocidos como la edad, estado hormonal, origen étnico y antecedentes familiares de PCa. El fondo genético es un factor de riesgo y existen reportes controversiales de la asociación de PCa y polimorfismos en los genes como son los receptores de vitamina D (VDR) y el de andrógenos (AR). Objetivo. Evaluar las repeticiones de tripletes de CAG en el primer exon del AR y polimorfismos en el sitio de restricción Taql en el VDR en mexicanos con PCa. Material y métodos. Se incluyeron 68 mexicanos con diagnóstico histopatológico de PCa y 48 mexicanos con niveles normales de antígeno prostático y tacto rectal normal. Se les extrajo 10 mL de sangre periférica para aislar DNA y mediante olígos específicos se evaluaron los polimorfismos mencionados. Resultados. La distribución alélica y genotípica de los polimorfismos en el AR y VDR fueron consistentes con el equilibrio de Hardy-Weinberg, y no mostraron diferencias significativas entre los casos y controles (p > 0.05). Sin embargo, el número de repeticiones de CAG en el AR fueron estadísticamente diferentes en pacientes jóvenes con PCa comparados con los controles (p = 0.045), cuando se comparó el grupo de pacientes de jóvenes contra aquellos mayores de 60 años no se encontró diferencia estadísticamente significativa (p - 0.085); sin embargo, se observó una tendencia de un número menor de repetidos CAG en pacientes mayores con PCa. Por otra parte, al comparar VDR en los pacientes con PCa de mal pronóstico por el patrón histológico tenían menor frecuencia de genotipos TT (p - 0.03). Conclusiones. Nuestros resultados sugieren una asociación entre los polimorfismos de los genes del VDR y AR, y el patrón histológico y la edad al diagnóstico en pacientes mexicanos con PCa, respectivamente. Sin embargo, es necesario confirmar estos resultados en un estudio con mayor número de pacientes.